Extensió llarga d'una cèl·lula eucariota amb aspecte de pèl. És capaç de realitzar moviments de sacsejada repetits gràcies a l'axonema que té al seu interior, la qual cosa proporciona capacitat de la natació a les cèl·lules portadores. Les cèl·lules amb flagels solen presentar un o dos flagels. Els flagels bacterians són més petits i completament diferents tant quant a l'estructura com pel mecanisme d'acció.